Prosto dostopno zbirko PubMed seatavljajo zapisi iz MEDLINE (bibliografski zapisi z abstrakti), PubMedCentral (celotna besedila člankov) in Bookshelf (celotna besedila knjig). Vsebuje preko 34 milijonov zapisov s področij bimedicinske znanosti, znanostih o življenju, biokemije, medicine, zdravstvene nege, biotehnologije itn. Zapisi lahko vsebujejo tudi povezave na celotna besedila tako prosto in odprto dostopnih vsebin kot tudi naročniških. Za dostop do vsebin, ki jih imajo naročene Centralna medicinska knjižnica in/ali ostale knjižnice Univerze v Ljubljani je potrebna prijava.